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Cette étude révèle que la vitrification des tissus neurales induit une vulnérabilité transcriptionnelle sélective, affectant de manière disproportionnée les gènes codant pour des protéines membranaires et du pathway sécrétoire, en particulier dans l'hippocampe.
Bien que la pré-amplification DLMDA permette une récupération robuste de l'ADN à partir d'échantillons FFPE sans introduire de biais régionaux ni d'artefacts de faux positifs, elle entraîne une réduction significative de la sensibilité de détection des altérations du nombre de copies, limitant ainsi son utilisation au dépistage génomique plutôt qu'à une analyse complète.
Cette étude évalue la stabilité à long terme de 44 nucléosides d'ARN en solution aqueuse à -80 °C et -20 °C, identifie des produits de dégradation et des problèmes de pureté, corrèle ces observations avec des calculs de chimie quantique, et propose des lignes directrices pratiques pour améliorer la fiabilité et la comparabilité interlaboratoires des analyses LC-MS des modifications de l'ARN.
Cette étude révèle que les transitions phénotypiques des cellules musculaires lisses vasculaires dans l'athérosclérose s'accompagnent de paysages épitranscriptomiques distincts, notamment caractérisés par des modifications d'uridine enrichies dans l'état pro-inflammatoire qui régulent l'expression génique post-transcriptionnelle.
Cette étude démontre que les profils de méthylation 2'-O du rRNA sont très similaires entre les ribosomes cytosoliques et ceux associés au réticulum endoplasmique dans divers types cellulaires humains, suggérant que cette modification n'est pas un déterminant majeur de la localisation ou de la fonction spécifique des ribosomes au niveau du RE.
Cette étude démontre que KDM2B, via ses domaines JmjC et CxxC, régule l'expression et l'activité de HIF-1 en favorisant le recrutement de l'ARN polymérase II, jouant ainsi un rôle essentiel dans l'adaptation cellulaire à l'hypoxie et la prolifération.
Cette étude révèle que les protéines « bicycle », des effecteurs d'aphides responsables de la formation de galles, adoptent des repliements de type saposine malgré une absence de similarité de séquence, et que leur diversité structurale extrême, mise en évidence par des prédictions structurales personnalisées, suggère une évolution rapide pour cibler diverses plantes ou échapper à leur immunité.
Cette étude révèle que l'infection par le virus Zika reprogramme l'épitranscriptome de l'hôte en induisant une polyadénylation alternative qui génère de nouveaux isoformes d'ARN ciblés préférentiellement par la méthyltransférase METTL3, entraînant un remodelage dynamique des modifications m6A.
Cette étude démontre que le crosstalk des barcodes en séquençage ONT, particulièrement problématique avec de faibles quantités d'ADN et l'ancien protocole, est considérablement réduit par la nouvelle version de l'organisme ou éliminé par une stratégie de regroupement des échantillons après l'adaptation des adaptateurs.
Cette étude démontre que le remodelage de la chromatine, en particulier via le complexe NuRD, permet le « réinitialisation » des enhancers en deux phases distinctes suite à la signalisation ERK, facilitant ainsi une réponse transcriptionnelle rapide et précise nécessaire à la détermination du destin cellulaire.
Les auteurs élargissent et optimisent le système de dégradation auxine-inductible AID2 pour les pathogènes Candida en développant de nouveaux vecteurs et stratégies de marquage génétique applicables aux souches prototrophes cliniques et à Candida auris, tout en fournissant des directives pour son utilisation efficace.
Les auteurs ont développé un dispositif hybride papier-polymère imprimé en 3D intégrant une porte logique ADN à quatre entrées pour la détection fluorescente sensible et spécifique du facteur de croissance dérivé des plaquettes BB (PDGF BB), un biomarqueur pertinent pour le dépistage de la prééclampsie précoce.
Cette étude utilise des simulations pour comparer les interactions moléculaires et les changements conformationnels induits par le ligand naturel SAM, l'analogue SAH et le candidat JS4 sur le riboswitch SAM-I, afin d'éclairer la conception de nouveaux antibiotiques ciblant l'ARN.
La vitamine D3 atténue la toxicité cutanée induite par l'azote moutarde en remodelant le microbiote intestinal pour enrichir *Akkermansia muciniphila* et augmenter la production de butyrate, un mécanisme médié par la voie de signalisation VDR-α-défensine dans l'intestin.
Cette étude identifie une mutation dans la boucle du précurseur du microARN miR-3260 chez le ver à soie *Bombyx mori*, associée à une peau larvaire translucide, et démontre que cette altération structurelle empêche le clivage par Dicer sans pour autant induire de phénotypes typiques liés à l'hormone juvénile.
Cette étude réalise une analyse génomique complète de la famille des gènes HMA chez le haricot mungo, caractérisant neuf gènes VrHMA et démontrant, via leur expression différentielle sous stress au zinc, au cadmium et au cuivre, leur rôle crucial dans l'homéostasie des métaux et la tolérance aux stress environnementaux.
Cette étude révèle que le ralentissement des ribosomes lors de la traduction favorise le ciblage efficace des protéines codées par le noyau vers les chloroplastes chez *Arabidopsis thaliana*.
Cette étude démontre que le virus Ebola reconfigure le protéome de la cellule hôte en mobilisant des kinases dépendantes des cyclines, notamment CDK2, pour favoriser sa réplication et sa transcription, identifiant ainsi ces voies de signalisation comme des cibles antivirales potentielles.
Cette étude identifie des variants régulateurs associés à la maladie de Parkinson dans les neurones dopaminergiques humains, démontrant que les allèles pathogènes aux loci SCARB2 et BAG3 altèrent l'accessibilité chromatinienne et réduisent l'expression génique, offrant ainsi des insights mécanistiques sur la pathologie.
En caractérisant le transcriptome mitochondrial du zébré par séquençage d'ARN direct à lecture longue, cette étude révèle l'existence d'un nouveau long ARN non codant polyadénylé nommé lncOriL, ainsi que de modifications inhabituelles des ARNm, dont la présence est conservée chez les téléostéens et les mammifères, y compris l'humain.